Agrume est nom masculin. On dit donc « un agrume ».

Cependant pour de nombreux gens, le féminin « une agrume » ne choque pas, car « agrume » est souvent employé au pluriel (les/des agrumes).

Ce terme n'est récent, sous cette forme masculine, que depuis le XXe siècle, où il a pris son sens moderne. Le Grand Dictionnaire Larousse universel du XIXe siècle (1864) avait enregistré le terme comme un nom féminin, mais le définissait comme une « ortie » et « une espèce de prune employée pour faire des pruneaux d’Agen ».

Agrume a été emprunté au XIXe siècle à l’italien agrume, nom qui est aussi masculin. Il est lui-même dérivé du latin médiéval acrumen, « fruit de saveur acide », « pommier sauvage, herbe piquante, etc. ».

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