Le désert de Bayouda est situé au nord de Khartoum au Soudan, à l'ouest de Kadabas, au sud du désert de Nubie. À eux deux ils forment la partie est du Sahara.

Le désert de Bayouda, qui se situe dans la boucle du Nil entre les 4e et 6e cataractes, se caractérise par sa roche basaltique noire issue d’anciens volcans. Une étude de photo géologique du Gebel Abu Nahl dans le désert de Bayouda a révélé qu'il s'agissait d'un cratère datant de la période pré-cambrienne, plus grand que tous les cratères connus à ce jour dans le nord du Soudan.

Deux principaux oueds traversent le désert avant de rejoindre le Nil, le Wadi Muqaddam qui coule du sud au nord et Wadi Abu Dom qui prend sa source au centre du désert et s'écoule de l'est à l'ouest.

On peut croiser dans le désert quelques gazelles dorcas et les troupeaux de chameaux et d’ânes des nomades Bisharin.

Au nord Soudan, sur le Nil, à la quatrième cataracte, le gouvernement a commencé en 2003 la construction du barrage de Méroé (nom de la ville engloutie), décidant de déplacer vers les déserts de Bayouda et de Nubie plus de 70 000 fermiers qui vivaient le long du Nil.

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