Au début de la série, Harry Potter est décrit comme assez frêle et chétif, dû à sa malnutrition chez les Dursley. Il est assez petit pour son âge, avec des genoux noueux. À quinze ans, il est décrit comme étant pâle et légèrement maladif, comme une personne ayant « beaucoup grandi en peu de temps », et son apparence est négligée en dehors des périodes scolaires. Tout au long de l'histoire, d'autres personnages s'évertuent à lui rappeler qu'il a le physique de son père sans grande précision : les cheveux noirs en bataille3. Mais il a les yeux vert émeraude et en forme d'amande de sa mère. Il porte des lunettes rondes à monture noire et une fine cicatrice en forme d'éclair sur le front, souvent cachée par ses mèches.

Harry est assez timide et plutôt modeste. Il reconnaît très volontiers la difficulté, voire l'incapacité, d'affronter ses peurs et son principal ennemi sans l'aide précieuse de ses amis, en particulier celle de Ron et d'Hermione. Comme d'autres élèves de la maison Gryffondor à laquelle il appartient, Harry sait faire preuve de courage et de discernement, même si ses sentiments l'emportent quelquefois sur sa sagesse (comme Hermione le lui rappelle souvent). Il peut aussi lui arriver quelquefois de perdre patience et de faire exploser sa colère, notamment en cinquième année, alors qu'il est tenu volontairement à l'écart des événements majeurs par les membres de l'Ordre du Phénix, et après la mort de son parrain, alors qu'il est retenu dans le bureau de Dumbledore.

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